Les lagunes sont des plans d'eau littoraux, généralement de faible profondeur, séparés de la mer par un cordon littoral appelé lido. D'un point de vue hydrologique, la communication avec le milieu marin est réalisée par un grau. Le caractère temporaire ou permanent de ces échanges avec la mer confère aux eaux lagunaires un caractère saumâtre.

Etang de Vic (complexe des étangs palavasiens), crédit : SIEL
Comprises entre terre et mer, les lagunes entretiennent tout naturellement des relations étroites avec les zones humides qui l'entourent (marais, etc.) et reçoivent de nombreux apports du bassin versant. Scientifiquement, les lagunes sont définies comme des milieux paraliques (Guelorget et Perthuisot, 1984).Localement, dans le langage courant, le mot 'étang' qui désigne différents types d'écosystèmes naturels ou artificiels se substitue à l'appelation 'lagune'.
La superficie des complexes lagunaires (lagune + zones humides périphériques) a été estimée à environ 130 000 ha sur les 3 régions méditerranéennes françaises (source: 'Synthèse des lagunes', 2007).

Etang du Vaccarès (Camargue) , crédit : M. Gauthier-Clerc/Tour du Valat
La profondeur des lagunes est généralement de l'ordre du mètre mais il existe des milieux beaucoup plus profonds, à mettre en relation avec leur origine géomorphologique :
La formation des lagunes méditerranéennes débute après la dernière glaciation, il y a plus de 20 000 ans. Sous l’effet du réchauffement climatique, le niveau marin, qui se situe alors à moins de 100 mètres par rapport au niveau actuel, s’élève progressivement. Au cours de sa lente remontée, la mer repousse devant elle les sédiments arrachés à la plate forme continentale. Le cordon sableux ainsi constitué sépare la mer des eaux saumâtres qui ont envahi les parties les plus basses de la plaine littorale. Seuls les graus, interruptions des lidos, maintiennent une communication entre les étangs et la mer originelle.
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Etang de Diana, crédit : DREAL Corse